RNA foi recuperado de uma espécie extinta pela primeira vez

Um novo estudo mostra o isolamento e sequenciamento de moléculas de RNA com mais de um século de idade de um espécime de tigre-da-tasmânia preservado em temperatura ambiente em uma coleção de museu. Isso resultou na reconstrução de transcriptomas de pele e músculo esquelético de uma espécie extinta pela primeira vez.

Os investigadores observam que as suas descobertas têm implicações relevantes para os esforços internacionais para ressuscitar espécies extintas, incluindo tanto o tigre-da-tasmânia como o mamute-lanoso, bem como para o estudo de vírus pandêmicos de RNA.

O tigre-da-tasmânia, também conhecido como tilacino, foi um notável marsupial carnívoro de ponta que já foi distribuído por todo o continente australiano e pela ilha da Tasmânia. Esta espécie extraordinária encontrou seu desaparecimento final após a colonização europeia, quando foi declarada como uma praga agrícola e uma recompensa de £ 1 por cada animal adulto morto foi estabelecida em 1888. O último tigre-da-tasmânia vivo conhecido morreu em cativeiro em 1936 no Zoológico Beaumaris em Hobart, Tasmânia.

Os esforços recentes de extinção concentraram-se no tigre-da-tasmânia, uma vez que o seu habitat natural na Tasmânia ainda está maioritariamente preservado e a sua reintrodução poderia ajudar a recuperar os equilíbrios do ecossistema perdidos após o seu desaparecimento final. No entanto, a reconstrução de um tigre-da-tasmânia funcional e vivo não requer apenas um conhecimento abrangente do seu genoma (DNA), mas também da dinâmica de expressão genética específica do tecido e de como funcionava a regulação genética, que só são alcançáveis ​​através do estudo do seu transcriptoma (RNA).

“Ressuscitar o tigre-da-tasmânia ou o mamute peludo não é uma tarefa trivial e exigirá um conhecimento profundo do genoma e da regulação do transcriptoma de espécies tão renomadas, algo que só agora começa a ser revelado”, diz Emilio Mármol, o líder autor de um estudo publicado recentemente na revista Genome Research por pesquisadores do SciLifeLab em colaboração com o Centro de Paleogenética, uma joint venture entre o Museu Sueco de História Natural e a Universidade de Estocolmo.

Moléculas de RNA recuperadas do tigre da Tasmânia

Os investigadores por detrás deste estudo sequenciaram, pela primeira vez, o transcriptoma da pele e dos tecidos musculares esqueléticos de um espécime dissecado de tigre-da-tasmânia com 130 anos de idade, preservado à temperatura ambiente no Museu Sueco de História Natural, em Estocolmo. Isto levou à identificação de assinaturas de expressão genética específicas de tecidos que se assemelham às dos mamíferos marsupiais e placentários existentes.

Os transcriptomas recuperados eram de tão boa qualidade que foi possível identificar RNAs codificadores de proteínas específicas de músculos e pele, e levaram à anotação de genes ausentes de RNA ribossômico e microRNA, o último seguindo as recomendações do MirGeneDB.

“Esta é a primeira vez que tivemos um vislumbre da existência de genes reguladores específicos do tilacino, como os microRNAs, que foram extintos há mais de um século”, diz Marc R. Friedländer, professor associado do Departamento de Biociências Moleculares. , Instituto Wenner-Gren da Universidade de Estocolmo e SciLifeLab.

Este estudo pioneiro abre novas oportunidades e implicações interessantes para a exploração das vastas coleções de espécimes e tecidos armazenados em museus de todo o mundo, onde moléculas de RNA podem aguardar para serem descobertas e sequenciadas.

“No futuro, poderemos recuperar RNA não apenas de animais extintos, mas também genomas de vírus RNA, como o SARS-CoV2 e seus precursores evolutivos, a partir de peles de morcegos e outros organismos hospedeiros mantidos em coleções de museus”, diz Love Dalén, professor de genômica evolutiva na Universidade de Estocolmo e do Centro de Paleogenética.

Os autores do estudo dizem que estão entusiasmados com futuros desenvolvimentos de pesquisas holísticas que integrem tanto a genômica quanto a transcriptômica em direção a uma nova era na paleogenética além do DNA.